重庆市第一批14个区县（自治县）级自然保护区设立备案公示
| 序号 | 名称 | 申报 备案 | 主管 部门 | 管理机构 | 类型 | 地点 | 地理坐标 | 主要保护 对象 | 总面积 （公顷） | |
| 1 | 大足西山桫椤 自然保护区 | 县政府 | 县林业局 | 西山林场 | 森林生态系统 | 西山林场二工区 | 东经：105°53′；北纬：29°35′ | 桫椤、桢楠及生境 | 988.4 | |
| 2 | 北碚茅庵 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 茅庵林场 | 森林生态系统 | 北碚区三圣镇 | 东经：106°31′－106°44′；北纬：29°46′－30°01′ | 常绿阔叶林 | 1898 | |
| 3 | 北碚金刀峡 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 嘉华林场 | 森林生态 | 北碚区静观镇 | 东经：106°37′－106°38′；北纬：30°－30°8′ | 常绿阔叶林 | 1733 | |
| 4 | 北碚小三峡 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 观音峡林场 | 森林系统生态 | 北碚区龙凤桥 | 东经：106°18′－106°33′；北纬：29°39′－29°51′ | 常绿阔叶林 | 2847 | |
| 5 | 涪陵江东桫椤 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 江东桫椤 自然保护区管理所 | 森林生态系统 | 涪陵区磨盘沟 | 东经107。26’05〞—107。22’36〞，北纬29。38’29〞—29。44’29〞 | 桫椤等 | 2500 | |
| 6 | 璧山黄岭鹭类 自然保护区 | 县政府 | 县林业局 | 县林业局 | 野生动物系统 | 璧山县正兴镇黄岭 | 鹭类 | 1500 | ||
| 7 | 山巫梨子坪 自然保护区 | 县政府 | 县林业局 | 梨子坪管理处 | 森林生态系统 | 巫山县骡坪镇 | 东径109°50′-110°10′，北纬30°10′-30°20′ | 红豆杉、连香书，云豹、巫山北鲵等 | 1397 | |
| 8 | 綦江长田 自然保护区 | 县政府 | 县林业局 | 长田管理所 | 森林生态系统 | 綦江县永新镇 | 东经：106°30′--106°33′45″；北纬：28°52′--28°55′ | 红豆杉、福建柏 | 17333 | |
| 9 | 綦江万隆 自然保护区 | 县政府 | 县林业局 | 万隆管理所 | 野生动物系统 | 綦江县石壕镇 | 东经：186°61′--186°68′；北纬：28°27′--31°54′ | 猕猴 | 17333 | |
| 10 | 合川南方大口鲢 种质资源保护区 | 区政府 | 区农业局 | 区鱼政鱼港监督管理站 | 野生动物系统 | 合川区云门镇至盐井镇江段 | 南方大口鲢 | 2000 | ||
| 11 | 九龙坡白露 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 三多桥管委会 | 野生动物系统 | 白市驿三多桥镇 | 东经106。14’45〞—106。22’15〞，北纬29。30’14〞—29。31’40〞 | 鹭类及生境 | 283.54 | |
| 12 | 酉阳三黛沟大鲵 自然保护区 | 县政府 | 县水电局 | 保护区管理处 | 野生动物系统 | 龙潭镇王家河 | 东经108°54′28″，北纬28°47′50″ | 大鲵及生境 | 9400 | |
| 13 | 江津中山鹭类 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 区林业局 | 野生动物系统 | 中山镇鱼湾、新铺 | 东经108°19′－108°21′，北纬28°47′－28°50′ | 鹭类及生境 | 666.7 | |
| 14 | 江津滚子坪桫椤 自然保护区 | 区政府 | 区林业局 | 塘河镇政府 | 森林生态系统 | 塘河镇滚子坪村 | 东经108°02′－106°05′，北纬28°54.5′－28°58′ | 桫椤及生境 | 1933 | |
| 序 号 | 名 称 | 级 别 | 保护 类型 | 主要保护对象 | 所在地 | 总面积 （公顷） | 核心区 | 缓冲区 | 实验区 | 主管部门 | 批准文号 | 批准 时间 |
| 1 | 白市驿自然保护区 | 区 | 白鹭 | 鹭类 | 九龙坡区 | 150 | 九龙坡区林业局 | 九府函[1998]60号 | 1998.6 | |||
| 2 | 西山自然保护区 | 县 | 珍稀植物类型 | 桫椤 | 大足县 | 988.4 | 250 | 238.4 | 500 | 大足县林业局 | 足府发[1998]99号 | 1998.8 |
| 3 | 龙头山自然保护区 | 区 | 白鹭 | 鹭类 | 沙区 | 100 | 50 | 50 | 沙区林业局 | 沙区府发[1999]60 号 | 1999.4 | |
| 4 | 大口鲶鱼类自然保护区 | 区 | 水产资源类型 | 大口鲶鱼 | 合川市 | 2000 | 1000 | 1000 | 合川市农业局 | 合川府发[1999]119号 | 1999.10 | |
| 5 | 万隆自然保护区 | 县 | 森林资源型 | 常绿阔叶林 | 綦江县 | 4800 | 1600 | 2000 | 1200 | 綦江县林业局 | 綦府发[2000]53号 | 2000.3 |
| 6 | 三黛沟自然保护区 | 县 | 水产资源类型 | 大鲵 | 酉阳县 | 9400 | 3800 | 5600 | 酉阳县水电局 | 酉阳县政府 | 1989.7 | |
| 7 | 黄岭鹭类自然保护区 | 县 | 白鹭 | 鹭类 | 璧山县 | 1500 | 500 | 1000 | 璧山县林业局 | 璧府[2000]32号 | 2000.9 | |
| 8 | 梨子坪自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 巫山县 | 1397 | 巫山县林业局 | 巫山府[2000]69号 | 2000.9 | |||
| 9 | 茂云山自然保护区 | 县 | 野生动物 | 云豹、 黄叶猴、 五步蛇等 | 彭水县 | 129000 | 64500 | 45000 | 19400 | 彭水县林业局 | 彭自发[2000]70号 | 2000.10 |
| 10 | 七跃山自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 彭水县 | 62000 | 31000 | 21700 | 9300 | 彭水县林业局 | 彭自发[2000]70号 | 2000.10 |
| 11 | 金刀峡自然保护区 | 区 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 北碚区 | 1733 | 1048 | 328 | 358 | 北碚区林业局 | 碚府发[2000]154号 | 2000.11 |
| 12 | 茅庵自然保护区 | 区 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 北碚区 | 1898 | 715.1 | 889 | 293.9 | 北碚区林业局 | 碚府发[2000]154号 | 2000.11 |
| 13 | 北碚小三峡自然保护区 | 区 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 北碚区 | 2847 | 北碚区林业局 | 碚府发[2000]154号 | 2000.11 | |||
| 14 | 天生三桥自然保护区 | 县 | 地质遗址 | 地质遗迹 | 武隆县 | 100 | 10 | 55 | 35 | 县建委 | 武府发[2000]67号 | 2000.12 |
| 15 | 长田自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 綦江县 | 19800 | 綦江县林业局 | 綦府发[2001]58号 | 2001.3. | |||
| 16 | 滚子坪自然保护区 | 区 | 珍稀植物 | 桫椤 | 江津市 | 1933.3 | 400 | 江津市林业局 | 江津府函[2001]115号 | 2001.4 | ||
| 17 | 中山鹭类自然保护区 | 区 | 白鹭 | 鹭类 | 江津市 | 666.7 | 333.3 | 江津市林业局 | 江津府函[2001]115号 | 2001.4 | ||
| 18 | 石子自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 忠 县 | 5333 | 忠县林业局 | 忠府[2001]67号 | 2001.8 | |||
| 19 | 巴营自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 忠 县 | 2000 | 忠县林业局 | 忠府[2001]67号 | 2001.8 | |||
| 20 | 精华自然保护区 | 县 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 忠 县 | 4000 | 忠县林业局 | 忠府[2001]67号 | 2001.8 | |||
| 21 | 天鹅湖自然保护区 | 县 | 综合类 | 奉节县 | 1333.24 | 73.1 | 466.64 | 793.5 | 奉节环保局 | 奉节府发[2002]65号 | 2002.10 | |
| 22 | 黑山自然保护区 | 区 | 森林植被 | 常绿阔叶林 | 万盛区 | 10136 | 万盛区林业局 | 万盛府发[2001]32号 | 2001.12 | |||
| 23 | 芙蓉江黑叶猴自然保护区 | 县 | 野生动物 | 野生动物 | 武隆县 | 21.6 | 武隆县林业局 | 2003.8 | ||||
| 24 | 江东桫椤自然保护区 | 区 | 珍稀植物 | 桫椤 | 涪陵区 | 2500 | 涪陵区林业局 | 2003.8 | ||||
| 25 | 圣灯山自然保护区 | 区 | 森林资源型 | 常绿阔叶林 | 巴南区 | 19 | 巴南区林业局 | 重办发[1982]74号 | 1982.5 | |||
| 26 | 玉峰山自然保护区 | 区 | 森林 | 常绿阔叶林 | 渝北区 | 43528 | 12623 | 19588 | 11317 | 渝北区林业局 | 渝北府函[2000]91号 | 2000.9 |